估计是没什么人回复你啦，做自由行攻略可是很伤身的
我上次去北海道道东8天自由行，确定酒店、交通、景点足足忙了我一个月
给你点建议吧
1、12天看似很长，但跑日本全国的话充其量也只能走马观花，时间都花在路上很不值得。看你的目的地基本上是动漫之旅，建议放弃北海道、冲绳这种以自然风光为主的地区，集中在东京、大阪、京都几个大景点周边。日本虽然公共交通比较便利，但在偏远地区也是会等车等到发霉的（除非自驾）……
2、景点还是要自己确定啊！日本旅游的主题很多，动漫、购物、历史、城堡、温泉、赏樱等等，别人根本无从推荐。建议参考一下国内的柯南主题旅行团的行程之类，增加一些其他动漫景点和地标性景点即可（时间绝对不够的）。
3、交通的话，自己找JR官网之类的下载时刻表就可以了。以日本公共交通的准时程度，行程甚至可以精确到分的。住宿的话，大城市里离电车站点近点就行了，比如东京。乡下的话就随便了，那种地方难道你晚上还有能出去玩吗？要选择的话，倒是应该考虑一下要住星级酒店、温泉酒店还是民宿吧。
4、日币还是国内多兑换一些吧。日本没有满大街的兑换点，真的花光了想要再换还是有点麻烦的。
5、移动wifi国内就有租，网上一搜就有。附近没有此类公司的话，在日本机场租也很方便。不过要注意运营商，性号覆盖范围会有一定的差异。
6、我觉得完全不需要什么小贴士。网上找找电车、巴士相关的一些自动设施如何使用就行了。日本政府虽然很扯淡，不过人民大部分还是很友好的，问个路都很热情。我上次自由行碰到一个台湾女生，基本不会说日语，独身一人拿张地图就走了。
4月份去日本一定不能错过樱花啊
你可以第一天去箱根 看看樱花 坐坐缆车 还能看见富士山 箱根的温泉很有名 可以找个温泉旅馆住
第二天从箱根坐巴士（要换一次）到富士急乐园 玩一天
第三天在东京都内的银座 新宿 秋叶原之类的可以购物 晚上坐夜行火车到松江再换车到鸟取县
也可以第四天坐新干线换特急（电车）或者直接坐飞机到鸟取
再来一天从鸟取到神户/大阪 坐飞机或者特急 在阪神地区转转
之后从阪神地区坐飞机到长崎 再从长崎坐电车到豪斯登堡 在那玩上一天
你想去的三个地方这些天就够了 你还可以去东京迪士尼乐园 大阪的环球影城 东京都内的东京塔 天空树 京都地区之类的 以及日本的世界遗产 日本三景之类的
做这种行程安排确实很头疼 无偿情况下我就帮你到这里了
从国内随便那一个设备 比如智能手机 到日本基本上不了wifi 因为日本的wifi都是要和日本的电信公司签协议之类的才能使用的 你可以在日本这边的机场租一个手机用
小贴士之类的吧 就是日本的铁路有的时候会出现偶然情况 什么人身事故啊 车辆检查啊 难免有晚点之类的 安排一定要有余量
楼上两位已经介绍了怎么旅游了，换日币最好在国内多换一些。在国外换不会说外语很困难。有一次我在越南跟旅游团走散了相当麻烦，钱也换不了。所以在国内一定多换一些。