研究院拥有分布在全国各地的20多个研究所和3个分院，并与国内许多科研、生产和使用部门，如中国科学院，各高等院校，中国空气动力研究与发展中心，各航空企业集团，各工业部门的研究与试验机构，军方和民用航空机构等有密切的合作关系。
中国航空研究院631所的研究所简介
在军品研制方面建有机载、弹载计算机重点实验室和流体力学（CFD）重点实验室。拥有EDA设计中心、多层印制电路板生产线、计算机模块和整机电装生产线、机载计算机机箱加工生产线。在民品发展方面，成立了“西安翔迅科技发展公司”（2006年公司改制，更名为“西安翔迅科技有限责任公司”）和“西安翔腾集成电路科技有限公司”，业务领域涉及网络通信、信息安全、数据库、自动控制、军机电子设备维修以及集成电路设计等。我所已初步形成一体两翼的格局，与美、英、德、法等国家的著名研究机构和公司有着广泛的学术交流与业务合作。在航空领域内，已经与美国Collins公司、 英国ULTRA公司在软件开发和测试方面进行了广泛的合作，取得了可喜的成绩。在并行计算机、容错计算机、分布式计算机、机载、弹载、舰载计算机、航空气动数值模拟、计算方法、计算机软件、软件工程、网络工程和办公自动化等计算机应用技术领域，为我国的国防现代化和国民经济的发展做出了突出贡献，取得了丰硕的成果。